除了箱內襯以防水材料外，還要為排水和通風在底板上設置間隙或者開孔。相鄰底板之間所留間隙的尺寸為0.5-1cm,開孔要開2個，并釘上百葉窗其位置要避開內裝物。除了這些辦法還有另外一些方法。
1、使用循環干燥還有冷凝去濕防濕可以防水，木包裝箱經過對被控空間濕度連續地或者間斷地檢測跟控制，讓被控空間的濕度保持在一定范圍內，完成對物資器材干燥封存的任務。
2、使用真空包裝也可以防水，經過密封的包裝木箱內抽真空的方式，完成防水的目的。
3、使用干燥劑也可以防水，木包裝箱為了避免被包裝產品容易受潮吸收水分，可以在包裝木箱內放一些干燥劑，然后吸收封裝的時候帶入包裝內的水分，然后令濕度保持在一定的范圍內。。
